Piqué de curiosité autant que d’orgueil, Hiro décide alors de rejoindre coûte que coûte la prestigieuse faculté. Pour cela, il doit s’inscrire au showcase de l’Institut de Technologie de San Fransokyo et présenter une invention assez novatrice pour séduire le jury d’entrée que le roboticien renommé préside lui-même.

Après de longues semaines de travail, Hiro est fin prêt pour le showcase : avec ses microrobots, de petits droïdes contrôlables par la pensée grâce à un bandeau qui leur est connecté et capables de se combiner à l’infini rendant possibles une myriade d’applications concrètes (dans les domaines de la construction, des transports…), le cadet des frères Hamada triomphe. Les membres du jury sont unanimes, Hiro a toutes les qualités requises pour rejoindre la faculté. Robert Callaghan rejoint Hiro pour le féliciter alors que celui-ci vient de recevoir une juteuse offre financière d’Alistair Krei, le « pape » de l’industrie de haute technologie prêt à débourser de grosses sommes d’argent pour s’offrir la révolutionnaire invention du jeune génie. Manifestement, Callaghan est très hostile vis-à-vis d’Alistair Krei, l’un de ses anciens élèves, qu’il considère comme un homme d’affaire sans scrupules ni vergogne. Il est soulagé d’entendre Hiro décliner l’offre de Krei et lui remet avec d’autant plus de plaisir la lettre qui l’invite à s’inscrire dans son université. Malheureusement, la joie est de courte durée pour Hiro Hamada. Alors que les deux frères Hamada célèbrent ensemble le succès de Hiro à quelques encablures de la faculté, ils sont alertés par des gens qui fuient en courant. En les questionnant sur les raisons de leur panique, Tadashi apprend que l’Institut de Technologie de San Fransokyo est ravagé par un incendie et que le Professeur Callaghan en est prisonnier. N’écoutant que son courage, il se précipite à l’intérieur de la faculté en flammes. Resté à l’extérieur, Hiro est soufflé par l’explosion qui détruit l’université, ses microrobots qui s’y trouvaient toujours, et cause le décès de Tadashi et du professeur Callaghan. Les deux victimes sont enterrées dans les jours suivants ce dramatique accident.

Ce n’est que bien des semaines plus tard que Hiro comprend que l’incendie dans lequel son frère et le professeur Callaghan ont perdu la vie n’avait au final rien d’accidentel : il a été causé par un super-méchant portant un masque de kabuki dans le but de masquer le vol des microrobots qu’il utilise désormais pour accomplir de mystérieux desseins. Le jeune surdoué n’a dès lors plus qu’une seule obsession : arrêter le criminel au masque de kabuki et découvrir qui se cache derrière. Pendant longtemps, Hiro et les camarades d’université de Tadashi, ayant entre temps formé une équipe de super-héros amateurs bien décidés à neutraliser Yokai, soupçonnent Alistair Krei, le vénal magnat des nouvelles technologies, d’être le super-méchant masqué. C’est donc une terrible surprise lorsque ceux-ci découvrent que derrière le masque de kabuki se cache en fait Robert Callaghan. C’est lui qui a incendié l’université pour faire disparaître les traces du vol des microrobots qu’il a utilisé pour se protéger des flammes. Le génial roboticien qu’il est a immédiatement compris le potentiel de l’invention de Hiro pour mener à bien la vengeance qui le dévore. En effet, Callaghan considère Alistair Krei comme l’unique responsable de la disparition de sa fille unique Abigail. Celle-ci a en effet été victime de l’échec d’une expérimentation menée par Krei Tech, le projet « Moineau Silencieux » : deux portails interconnectés permettant la téléportation de la matière. C’est au titre de pilote qu’Abigail a participé au projet et a conduit sa navette à l’intérieur d’un des deux portails. Malheureusement, un dysfonctionnement du confinement magnétique entraîne une implosion d’un des deux portails et oblige l’équipe scientifique à déconnecter la machine à l’intérieur de laquelle Abigail reste alors prisonnière. C’est ce drame terrible qui a fait naître dans le cœur de Callgahan une haine irréductible contre Alistair Krei et l’a conduit à devenir un criminel. L’occasion rêvée pour lui d’assouvir sa soif de vengeance se présente quelques heures après la découverte de la véritable identité de Yokai par Hiro et ses amis : Krei doit inaugurer devant une foule nombreuse le nouveau building high-tech de son entreprise de haute technologie. Les super-héros en herbe s’empressent d’y aller, sûrs que Callaghan va frapper.

En effet, caché derrière son masque de kabuki, il fait irruption dès le début de la cérémonie d’inauguration du nouveau site de Krei Tech Industries. A l’aide de ses microrobots, il attrape Alistair Krei et l’emmène avec lui dans les airs. Callaghan veut faire subir à Krei ce qu’il a dû endurer : assister impuissant à la disparition de ce qu’il a de plus cher. Parvenu à reconstituer l’un des portails de téléportation, Callaghan veut faire disparaître, morceau après morceau, le building de Krei Tech… Ce n’est que lorsque le magnat aura vu s’effondrer sous ses yeux son empire que Callaghan en finira définitivement avec lui. Hiro et ses amis font alors irruption : le jeune surdoué tente de raisonner Callaghan en lui disant que la vengeance ne lui ramènera pas sa fille mais celui-ci refuse de l’écouter.